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Uso del conector de Synapse.org en Claude

Actualizado esta semana

La integración de Synapse.org de Sage Bionetworks permite a los investigadores descubrir datos biomédicos en todo Synapse, ver la estructura de los proyectos y recuperar información sobre sus activos de datos para usuarios autorizados. Este artículo explica cómo configurar y usar la integración de Synapse.org con Claude para avanzar en sus flujos de trabajo de investigación y análisis.

La integración de Synapse.org se basa en la capacidad de Claude para usar conectores remotos.

Qué proporciona esta integración

Los servicios incluyen búsqueda y servicios de recuperación de (meta)datos. El acceso a los datos estará regido por los controles de acceso definidos para cada proyecto. Algunos datos están disponibles públicamente, mientras que otros requieren aprobación del equipo de gobernanza de Synapse antes del acceso.

Quién puede acceder a la integración de Synapse.org

  • Personas que tengan una cuenta registrada de Synapse (regístrese gratis)

  • El acceso a los datos puede estar sujeto a restricciones de uso por parte de los contribuyentes

Más detalles sobre el acceso a la integración se pueden encontrar en la Documentación del Servidor MCP de Synapse.

Configuración de la integración de Synapse.org

Para Propietarios de Organizaciones (Team y Enterprise)

  1. Navegue a Configuración de administrador > Conectores

  2. Haga clic en "Explorar conectores"

  3. Haga clic en "Synapse.org"

  4. Haga clic en "Agregar a su equipo"

Para Usuarios Individuales de Claude

  1. Navegue a Configuración > Conectores

  2. Haga clic en "Conectar"

  3. Siga las instrucciones para autenticarse con su cuenta de Synapse.org

Para Usuarios de Claude Code

  1. Comando: /plugin marketplace add anthropics/life-sciences

  2. Comando: /plugin install synapse@life-sciences

  3. Reinicie Claude Code

  4. Verifique que el servidor esté conectado con /mcp

Los detalles técnicos de la integración de Synapse.org se pueden encontrar en la Documentación del Servidor MCP de Synapse.

Casos de uso comunes

  • Buscar datos científicos reutilizables en toda la plataforma Synapse.org

    • "Encuentra conjuntos de datos de RNA-seq relacionados con la enfermedad de Alzheimer en Synapse"

    • "Busca en Synapse conjuntos de datos de transcriptómica de células individuales"

    • "Encuentra datos de secuenciación genómica para neurofibromas plexiformes en el Portal de Datos NF"

  • Los usuarios autorizados pueden ver la jerarquía de carpetas, archivos, tablas, conjuntos de datos dentro de los proyectos para ayudar a organizar y monitorear los activos de datos

    • "Explica los archivos y carpetas en el proyecto público AACR Project GENIE"

    • "Dame una descripción rápida de los activos de datos en el proyecto del desafío SEA-AD con pista agéntica (syn66496696)?"

  • Obtener metadatos personalizados de entidades en Synapse

    • "¿Cuáles son las anotaciones y metadatos para el archivo syn4553239?"

    • "Muéstrame los campos de metadatos personalizados para el conjunto de datos syn66364675"

  • Obtener información de procedencia para entidades en Synapse para ayudar a comprender el procesamiento de datos anterior

    • "¿Cuál es el historial de procesamiento para el archivo syn51543273?"

    • "Muéstrame el linaje de datos y las dependencias ascendentes para el conjunto de datos syn68719289"

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