L'intégration Synapse.org par Sage Bionetworks permet aux chercheurs de découvrir des données biomédicales sur l'ensemble de Synapse, de voir la structure des projets et de récupérer des informations sur leurs actifs de données pour les utilisateurs autorisés. Cet article explique comment configurer et utiliser l'intégration Synapse.org avec Claude pour faire progresser vos flux de travail de recherche et d'analyse.
L'intégration Synapse.org s'appuie sur la capacité de Claude à utiliser des connecteurs distants.
Ce que cette intégration fournit
Les services incluent des services de recherche et de récupération de (méta)données. L'accès aux données sera régi par les contrôles d'accès définis pour chaque projet. Certaines données sont accessibles au public, tandis que d'autres nécessitent l'approbation de l'équipe de gouvernance de Synapse avant l'accès.
Qui peut accéder à l'intégration Synapse.org
Les personnes qui ont un compte Synapse enregistré (s'inscrire gratuitement)
L'accès aux données peut être soumis à des restrictions d'utilisation de la part des contributeurs
Plus de détails sur l'accès à l'intégration peuvent être trouvés dans la documentation du serveur MCP de Synapse.
Configuration de l'intégration Synapse.org
Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise)
Accédez à Paramètres d'administration > Connecteurs
Cliquez sur « Parcourir les connecteurs »
Cliquez sur « Synapse.org »
Cliquez sur « Ajouter à votre équipe »
Pour les utilisateurs individuels de Claude
Accédez à Paramètres > Connecteurs
Cliquez sur « Connecter »
Suivez les instructions pour vous authentifier avec votre compte Synapse.org
En savoir plus sur la recherche et la connexion d'outils dans Claude.
Pour les utilisateurs de Claude Code
Commande :
/plugin marketplace add anthropics/life-sciencesCommande :
/plugin install synapse@life-sciencesRedémarrez Claude Code
Vérifiez que le serveur est connecté avec
/mcp
Les détails techniques de l'intégration Synapse.org peuvent être trouvés dans la documentation du serveur MCP de Synapse.
Cas d'usage courants
Rechercher des données scientifiques réutilisables sur l'ensemble de la plateforme Synapse.org
« Trouver des ensembles de données RNA-seq liés à la maladie d'Alzheimer dans Synapse »
« Rechercher dans Synapse des ensembles de données de transcriptomique monocellulaire »
« Trouver des données de séquençage génomique pour les neurofibromes plexiformes dans le portail de données NF »
Les utilisateurs autorisés peuvent voir la hiérarchie des dossiers, fichiers, tableaux, ensembles de données au sein des projets pour aider à organiser et surveiller les actifs de données
« Expliquez les fichiers et dossiers du projet public AACR Project GENIE »
« Donnez-moi un aperçu rapide des actifs de données du projet de défi SEA-AD avec piste agentique (syn66496696) ? »
Obtenir des métadonnées personnalisées des entités dans Synapse
« Quelles sont les annotations et métadonnées du fichier syn4553239 ? »
« Montrez-moi les champs de métadonnées personnalisés pour l'ensemble de données syn66364675 »
Obtenir des informations de provenance pour les entités dans Synapse afin de comprendre le traitement des données passées
« Quel est l'historique de traitement du fichier syn51543273 ? »
« Montrez-moi la lignée des données et les dépendances en amont pour l'ensemble de données syn68719289 »