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Utilizzo dell'Estensione 10x Genomics in Claude

Aggiornato ieri

L'integrazione 10x Genomics trasforma l'analisi di singole cellule e spaziale in un flusso di lavoro semplice e conversazionale. I biologi possono facilmente analizzare i propri dati di sequenziamento, mentre i laboratori centrali possono eseguire rapidamente l'elaborazione batch. Questo articolo spiega come configurare e utilizzare l'integrazione 10x Genomics con Claude per avanzare i tuoi flussi di lavoro di analisi.

L'integrazione 10x Genomics è disponibile come estensione desktop nell'app Claude Desktop (scarica qui), e si basa sulla capacità di Claude di utilizzare connettori locali tramite un'estensione desktop.

Cosa fornisce questa integrazione

L'integrazione 10x Genomics consente ai ricercatori di creare e gestire flussi di lavoro di analisi genomica di singole cellule in conversazione con Claude. Gli utenti possono caricare dati, configurare e avviare pipeline Cell Ranger, monitorare lo stato dell'analisi e scaricare i risultati utilizzando prompt in linguaggio naturale invece di strumenti da riga di comando o interfacce web. L'integrazione traduce le richieste conversazionali in azioni sulla piattaforma 10x Cloud Analysis, semplificando i flussi di lavoro per analisi di espressione genica, multiplexing cellulare e screening CRISPR.

Chi dovrebbe utilizzare l'integrazione 10x Genomics

  • Biologi computazionali: Ricercatori che analizzano dati genomici di singole cellule e desiderano semplificare i flussi di lavoro di analisi basati su cloud

  • Bioinformatici: Scienziati che elaborano più campioni e hanno bisogno di efficienti capacità di elaborazione batch

  • Ricercatori scientifici: Ricercatori di laboratorio che generano dati di singole cellule e desiderano un'interfaccia intuitiva per eseguire pipeline standard

  • Responsabili di strutture centrali: Personale che elabora campioni per più gruppi di ricerca e ha bisogno di gestire numerose analisi

Chi può accedere all'integrazione 10x Genomics

Qualsiasi utente con un account 10x Cloud Analysis (crea un account gratuito qui)

Ulteriori dettagli sull'accesso all'integrazione si trovano nella documentazione del server MCP 10x Genomics.

Configurazione dell'integrazione 10x Genomics

L'integrazione 10x Genomics è disponibile come estensione desktop nell'app Claude Desktop (scarica qui). Per i proprietari di organizzazioni (Team ed Enterprise), la configurazione dell'integrazione comporta la messa a disposizione dell'estensione per la tua organizzazione. Per gli utenti individuali, la configurazione dell'integrazione comporta l'installazione dell'estensione dall'interno dell'app Claude Desktop.

Per i proprietari di organizzazioni (Team ed Enterprise)

  1. Vai a Impostazioni amministratore > Estensioni

  2. Nel campo di ricerca, digita "10x Genomics"

  3. Fai clic su "Abilita"

  4. Istruisci il tuo team a scaricare l'app Claude Desktop per accedere all'integrazione

Per gli utenti Claude individuali

  1. Vai a Impostazioni > Estensioni

  2. Fai clic su "Sfoglia estensioni"

  3. Fai clic su "10x Genomics"

  4. Fai clic su "Installa"

  5. Segui le istruzioni per autenticarti con il tuo account 10x Cloud Analysis

I dettagli tecnici dell'integrazione 10x Genomics si trovano nella documentazione del server MCP 10x Genomics.

Per gli utenti di Claude Code

  1. Comando: /plugin marketplace add anthropics/life-sciences

  2. Comando: /plugin install 10x-genomics@life-sciences

  3. Riavvia Claude Code

  4. Comando: /plugin

  5. Vai a "Gestisci e disinstalla plugin" e configura l'MCP 10x Genomics con il tuo token di accesso

  6. Riavvia Claude Code ancora una volta

  7. Verifica che il server sia connesso con /mcp

Casi d'uso comuni

  • Configurare un'analisi Cell Ranger count

  • Configurare un'analisi Cell Ranger multi con multiplexing

  • Elaborare batch di più campioni

  • Monitorare e scaricare i risultati dell'analisi

  • Interpretare le metriche QC e i risultati

I prompt di esempio e le migliori pratiche di prompting si trovano nella documentazione del server MCP 10x Genomics.

Altre risorse da 10x Genomics

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