Sage Bionetworksによるsynapse.org統合により、研究者はSynapse全体で生物医学データを発見し、プロジェクトの構造を確認し、認可されたユーザーのデータ資産に関する情報を取得できます。この記事では、Claudeとのsynapse.org統合をセットアップして使用し、研究および分析ワークフローを進める方法について説明します。
synapse.org統合は、Claudeのリモートコネクタを使用する機能に依存しています。
この統合が提供するもの
サービスには、検索および(メタ)データ取得サービスが含まれます。データアクセスは、各プロジェクトに定義されたアクセス制御によって管理されます。一部のデータは公開されていますが、その他のデータはアクセス前にSynapseのガバナンスチームからの承認が必要です。
synapse.org統合にアクセスできるユーザー
登録されたSynapseアカウントを持つ個人(無料で登録)
データアクセスは、貢献者による使用制限の対象となる場合があります
統合へのアクセスに関する詳細は、SynapseのMCPサーバードキュメントをご覧ください。
synapse.org統合のセットアップ
組織オーナー向け(Claude TeamおよびEnterprise)
管理設定 > コネクタに移動します
「コネクタを参照」をクリックします
「synapse.org」をクリックします
「チームに追加」をクリックします
個人のClaudeユーザー向け
設定 > コネクタに移動します
「接続」をクリックします
指示に従ってsynapse.orgアカウントで認証します
Claudeでのツールの検索と接続について詳しく学びましょう。
Claude Codeユーザー向け
コマンド:
/plugin marketplace add anthropics/life-sciencesコマンド:
/plugin install synapse@life-sciencesClaude Codeを再起動します
/mcpでサーバーが接続されていることを確認します
synapse.org統合の技術的詳細は、SynapseのMCPサーバードキュメントをご覧ください。
一般的な使用例
synapse.orgプラットフォーム全体で再利用可能な科学データを検索
「Synapseでアルツハイマー病に関連するRNA-seqデータセットを検索して」
「Synapseで単一細胞トランスクリプトミクスデータセットを検索して」
「NFデータポータルで叢状神経線維腫のゲノムシーケンシングデータを検索して」
認可されたユーザーは、プロジェクト内のフォルダ、ファイル、テーブル、データセットの階層を確認し、データ資産の整理と監視を支援できます
「公開されているAACR Project GENIEプロジェクトのファイルとフォルダについて説明して」
「エージェンティックトラック(syn66496696)を含むSEA-ADチャレンジプロジェクトのデータ資産の概要を教えて」
Synapse内のエンティティのカスタムメタデータを取得
「ファイルsyn4553239のアノテーションとメタデータは何ですか?」
「データセットsyn66364675のカスタムメタデータフィールドを表示して」
Synapse内のエンティティのプロベナンス情報を取得し、過去のデータ処理を理解するのに役立てます
「ファイルsyn51543273の処理履歴は何ですか?」
「データセットsyn68719289のデータ系譜と上流の依存関係を表示して」