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Claudeで10x Genomics拡張機能を使用する

今週アップデートされました

10x Genomics統合により、シングルセルおよび空間解析がシンプルで会話的なワークフローに変わります。生物学者は自分のシーケンシングデータを簡単に解析でき、コアラボは迅速にバッチ処理を実行できます。この記事では、Claudeで10x Genomics統合をセットアップして使用し、解析ワークフローを進化させる方法について説明します。

10x Genomics統合は、Claude Desktop App(こちらからダウンロード)のデスクトップ拡張機能として利用でき、Claudeのデスクトップ拡張機能を介したローカルコネクタの使用機能に依存しています。

この統合が提供するもの

10x Genomics統合により、研究者はClaudeとの会話の中でシングルセルゲノミクス解析ワークフローを作成および管理できます。ユーザーは、コマンドラインツールやWebインターフェースの代わりに自然言語プロンプトを使用して、データのアップロード、Cell Rangerパイプラインの設定と起動、解析ステータスの監視、結果のダウンロードを行うことができます。この統合は、会話形式のリクエストを10x Cloud Analysisプラットフォーム上のアクションに変換し、遺伝子発現、細胞マルチプレックス、CRISPRスクリーニング解析のワークフローを効率化します。

10x Genomics統合を使用すべき人

  • 計算生物学者:シングルセルゲノミクスデータを解析し、クラウドベースの解析ワークフローを効率化したい研究者

  • バイオインフォマティシャン:複数のサンプルを処理し、効率的なバッチ処理機能が必要な科学者

  • 研究科学者:シングルセルデータを生成し、標準パイプラインを実行するための直感的なインターフェースを求めるラボ研究者

  • コア施設マネージャー:複数の研究グループのサンプルを処理し、多数の解析を管理する必要があるスタッフ

10x Genomics統合にアクセスできる人

10x Cloud Analysisアカウントを持つすべてのユーザー(こちらから無料アカウントを作成)

統合へのアクセスに関する詳細は、10x Genomics MCPサーバードキュメントをご覧ください。

10x Genomics統合のセットアップ

10x Genomics統合は、Claude Desktop App(こちらからダウンロード)のデスクトップ拡張機能として利用できます。組織オーナー(TeamおよびEnterprise)の場合、統合のセットアップには組織で拡張機能を利用可能にすることが含まれます。個人ユーザーの場合、統合のセットアップにはClaude Desktop App内から拡張機能をインストールすることが含まれます。

組織オーナー(TeamおよびEnterprise)向け

  1. 管理設定 > 拡張機能に移動します

  2. 検索フィールドに「10x Genomics」と入力します

  3. 「有効化」をクリックします

  4. 統合にアクセスするためにClaude Desktop Appをダウンロードするようチームに指示します

個人Claudeユーザー向け

  1. Claude Desktop Appをダウンロードします

  2. 設定 > 拡張機能に移動します

  3. 「拡張機能を参照」をクリックします

  4. 「10x Genomics」をクリックします

  5. 「インストール」をクリックします

  6. 指示に従って10x Cloud Analysisアカウントで認証します

10x Genomics統合の技術的詳細は、10x Genomics MCPサーバードキュメントをご覧ください。

Claude Codeユーザー向け

  1. コマンド:/plugin marketplace add anthropics/life-sciences

  2. コマンド:/plugin install 10x-genomics@life-sciences

  3. Claude Codeを再起動します

  4. コマンド:/plugin

  5. 「プラグインの管理とアンインストール」に移動し、アクセストークンで10x Genomics MCPを設定します

  6. Claude Codeをもう一度再起動します

  7. /mcpでサーバーが接続されていることを確認します

一般的な使用例

  • Cell Rangerカウント解析のセットアップ

  • マルチプレックスを使用したCell Rangerマルチ解析のセットアップ

  • 複数サンプルのバッチ処理

  • 解析結果の監視とダウンロード

  • QCメトリクスと結果の解釈

サンプルプロンプトとプロンプトのベストプラクティスは、10x Genomics MC

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