Интеграция 10x Genomics преобразует анализ отдельных клеток и пространственный анализ в простой, диалоговый рабочий процесс. Биологи могут легко анализировать собственные данные секвенирования, а центральные лаборатории могут быстро выполнять пакетную обработку. В этой статье объясняется, как настроить и использовать интеграцию 10x Genomics с Claude для улучшения ваших рабочих процессов анализа.
Интеграция 10x Genomics доступна как расширение для рабочего стола в приложении Claude Desktop App (скачайте здесь), и она основана на возможности Claude использовать локальные соединители через расширение для рабочего стола.
Что предоставляет эта интеграция
Интеграция 10x Genomics позволяет исследователям создавать и управлять рабочими процессами анализа геномики отдельных клеток в диалоге с Claude. Пользователи могут загружать данные, настраивать и запускать конвейеры Cell Ranger, отслеживать статус анализа и загружать результаты, используя естественные языковые запросы вместо инструментов командной строки или веб-интерфейсов. Интеграция преобразует диалоговые запросы в действия на платформе 10x Cloud Analysis, оптимизируя рабочие процессы для анализа экспрессии генов, мультиплексирования клеток и анализа CRISPR.
Кто должен использовать интеграцию 10x Genomics
Вычислительные биологи: Исследователи, которые анализируют данные геномики отдельных клеток и хотят оптимизировать облачные рабочие процессы анализа
Биоинформатики: Ученые, которые обрабатывают несколько образцов и нуждаются в эффективных возможностях пакетной обработки
Научные сотрудники: Лабораторные исследователи, которые генерируют данные отдельных клеток и хотят интуитивный интерфейс для запуска стандартных конвейеров
Менеджеры центральных лабораторий: Сотрудники, которые обрабатывают образцы для нескольких исследовательских групп и должны управлять многочисленными анализами
Кто может получить доступ к интеграции 10x Genomics
Любой пользователь с учетной записью 10x Cloud Analysis (создайте бесплатную учетную запись здесь)
Дополнительные сведения о доступе к интеграции можно найти в документации 10x Genomics MCP Server.
Настройка интеграции 10x Genomics
Интеграция 10x Genomics доступна как расширение для рабочего стола в приложении Claude Desktop App (скачайте здесь). Для владельцев организаций (Team и Enterprise) настройка интеграции включает предоставление расширения вашей организации. Для отдельных пользователей настройка интеграции включает установку расширения из приложения Claude Desktop App.
Для владельцев организаций (Team и Enterprise)
Перейдите в Admin settings > Extensions
В поле поиска введите "10x Genomics"
Нажмите "Enable"
Инструктируйте вашу команду загрузить Claude Desktop App для доступа к интеграции
Для отдельных пользователей Claude
Загрузите Claude Desktop App
Перейдите в Settings > Extensions
Нажмите "Browse extensions"
Нажмите "10x Genomics"
Нажмите "Install"
Следуйте инструкциям для аутентификации с вашей учетной записью 10x Cloud Analysis
Технические детали интеграции 10x Genomics можно найти в документации 10x Genomics MCP Server.
Для пользователей Claude Code
Команда:
/plugin marketplace add anthropics/life-sciencesКоманда:
/plugin install 10x-genomics@life-sciencesПерезагрузите Claude Code
Команда:
/pluginПерейдите в "Manage and uninstall plugins" и настройте 10x Genomics MCP с вашим токеном доступа
Перезагрузите Claude Code еще раз
Проверьте, что сервер подключен, с помощью
/mcp
Типичные варианты использования
Настройка анализа Cell Ranger count
Настройка анализа Cell Ranger multi с мультиплексированием
Пакетная обработка нескольких образцов
Мониторинг и загрузка результатов анализа
Интерпретация метрик контроля качества и результатов
Примеры запросов и лучшие практики формулирования запросов можно найти в документации 10x Genomics MCP Server