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在 Claude 中使用 10x Genomics 擴充功能

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10x Genomics 整合將單細胞和空間分析轉變為簡單的對話式工作流程。生物學家可以輕鬆分析自己的定序數據,而核心實驗室可以快速執行批次處理。本文說明如何設定和使用 10x Genomics 與 Claude 的整合,以推進您的分析工作流程。

10x Genomics 整合可作為 Claude Desktop App 中的桌面擴充功能(在此下載),它依賴於 Claude 透過桌面擴充功能使用本機連接器的能力。

此整合提供的功能

10x Genomics 整合使研究人員能夠透過與 Claude 的對話來建立和管理單細胞基因組學分析工作流程。使用者可以上傳數據、配置和啟動 Cell Ranger 管道、監控分析狀態,以及使用自然語言提示而非命令列工具或網頁介面來下載結果。該整合將對話式請求轉換為 10x Cloud Analysis 平台上的操作,簡化基因表達、細胞多重化和 CRISPR 篩選分析的工作流程。

誰應該使用 10x Genomics 整合

  • 計算生物學家:分析單細胞基因組學數據並希望簡化雲端分析工作流程的研究人員

  • 生物資訊學家:處理多個樣本並需要高效批次處理功能的科學家

  • 研究科學家:生成單細胞數據並希望獲得直觀介面來執行標準管道的實驗室研究人員

  • 核心設施經理:為多個研究小組處理樣本並需要管理眾多分析的工作人員

誰可以存取 10x Genomics 整合

任何擁有 10x Cloud Analysis 帳戶的使用者(在此建立免費帳戶

有關存取整合的更多詳細資訊,請參閱 10x Genomics MCP Server 文件

設定 10x Genomics 整合

10x Genomics 整合可作為 Claude Desktop App 中的桌面擴充功能(在此下載)。對於組織擁有者(Team 和 Enterprise),設定整合涉及向您的組織提供擴充功能。對於個別使用者,設定整合涉及從 Claude Desktop App 內部安裝擴充功能。

適用於組織擁有者(Team 和 Enterprise)

  1. 導覽至「管理設定」>「擴充功能」

  2. 在搜尋欄位中輸入「10x Genomics」

  3. 點擊「啟用」

  4. 指示您的團隊下載 Claude Desktop App 以存取整合

適用於個別 Claude 使用者

  1. 導覽至「設定」>「擴充功能」

  2. 點擊「瀏覽擴充功能」

  3. 點擊「10x Genomics」

  4. 點擊「安裝」

  5. 按照說明使用您的 10x Cloud Analysis 帳戶進行驗證

了解有關從目錄安裝桌面擴充功能的資訊。

10x Genomics 整合的技術詳細資訊可在 10x Genomics MCP Server 文件中找到。

適用於 Claude Code 使用者

  1. 命令:/plugin marketplace add anthropics/life-sciences

  2. 命令:/plugin install 10x-genomics@life-sciences

  3. 重新啟動 Claude Code

  4. 命令:/plugin

  5. 導覽至「管理和卸載外掛程式」並使用您的存取令牌配置 10x Genomics MCP

  6. 再次重新啟動 Claude Code

  7. 使用 /mcp 驗證伺服器已連接

常見使用案例

  • 設定 Cell Ranger 計數分析

  • 設定具有多重化的 Cell Ranger 多分析

  • 批次處理多個樣本

  • 監控和下載分析結果

  • 解釋 QC 指標和結果

樣本提示和提示最佳實踐可在 10x Genomics MCP Server 文件中找到。

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