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Verwendung der 10x Genomics-Erweiterung in Claude

Gestern aktualisiert

Die 10x Genomics-Integration verwandelt Single-Cell- und Spatial-Analysen in einen einfachen, konversativen Workflow. Biologen können ihre eigenen Sequenzierungsdaten leicht analysieren, während Core Labs schnell Batch-Verarbeitung durchführen können. Dieser Artikel erklärt, wie Sie die 10x Genomics-Integration mit Claude einrichten und verwenden, um Ihre Analyse-Workflows zu verbessern.

Die 10x Genomics-Integration ist als Desktop-Erweiterung in der Claude Desktop App verfügbar (hier herunterladen) und basiert auf Claudes Fähigkeit, lokale Konnektoren über eine Desktop-Erweiterung zu verwenden.

Was diese Integration bietet

Die 10x Genomics-Integration ermöglicht es Forschern, Single-Cell-Genomik-Analyse-Workflows im Gespräch mit Claude zu erstellen und zu verwalten. Benutzer können Daten hochladen, Cell Ranger-Pipelines konfigurieren und starten, den Analysestatus überwachen und Ergebnisse mit natürlichsprachigen Eingaben statt Befehlszeilenwerkzeugen oder Web-Interfaces herunterladen. Die Integration übersetzt konversative Anfragen in Aktionen auf der 10x Cloud Analysis-Plattform und optimiert Workflows für Genexpression, Cell Multiplexing und CRISPR-Screening-Analysen.

Wer sollte die 10x Genomics-Integration verwenden

  • Computational Biologists: Forscher, die Single-Cell-Genomik-Daten analysieren und Cloud-basierte Analyse-Workflows optimieren möchten

  • Bioinformatiker: Wissenschaftler, die mehrere Proben verarbeiten und effiziente Batch-Verarbeitungsfunktionen benötigen

  • Research Scientists: Laborwissenschaftler, die Single-Cell-Daten generieren und eine intuitive Schnittstelle für die Ausführung standardisierter Pipelines wünschen

  • Core Facility Manager: Mitarbeiter, die Proben für mehrere Forschungsgruppen verarbeiten und zahlreiche Analysen verwalten müssen

Wer kann auf die 10x Genomics-Integration zugreifen

Jeder Benutzer mit einem 10x Cloud Analysis-Konto (hier ein kostenloses Konto erstellen)

Weitere Details zum Zugriff auf die Integration finden Sie in der 10x Genomics MCP Server-Dokumentation.

Einrichtung der 10x Genomics-Integration

Die 10x Genomics-Integration ist als Desktop-Erweiterung in der Claude Desktop App verfügbar (hier herunterladen). Für Organization Owners (Team und Enterprise) umfasst die Einrichtung der Integration die Bereitstellung der Erweiterung für Ihre Organisation. Für einzelne Benutzer umfasst die Einrichtung der Integration die Installation der Erweiterung aus der Claude Desktop App.

Für Organization Owners (Team und Enterprise)

  1. Navigieren Sie zu Admin-Einstellungen > Erweiterungen

  2. Geben Sie im Suchfeld „10x Genomics" ein

  3. Klicken Sie auf „Aktivieren"

  4. Weisen Sie Ihr Team an, die Claude Desktop App herunterzuladen, um auf die Integration zuzugreifen

Für einzelne Claude-Benutzer

  1. Laden Sie die Claude Desktop App herunter

  2. Navigieren Sie zu Einstellungen > Erweiterungen

  3. Klicken Sie auf „Erweiterungen durchsuchen"

  4. Klicken Sie auf „10x Genomics"

  5. Klicken Sie auf „Installieren"

  6. Folgen Sie den Anweisungen zur Authentifizierung mit Ihrem 10x Cloud Analysis-Konto

Technische Details der 10x Genomics-Integration finden Sie in der 10x Genomics MCP Server-Dokumentation.

Für Claude Code-Benutzer

  1. Befehl: /plugin marketplace add anthropics/life-sciences

  2. Befehl: /plugin install 10x-genomics@life-sciences

  3. Starten Sie Claude Code neu

  4. Befehl: /plugin

  5. Navigieren Sie zu „Plugins verwalten und deinstallieren" und konfigurieren Sie die 10x Genomics MCP mit Ihrem Zugriffstoken

  6. Starten Sie Claude Code erneut neu

  7. Überprüfen Sie, dass der Server mit /mcp verbunden ist

Häufige Anwendungsfälle

  • Einrichtung einer Cell Ranger Count-Analyse

  • Einrichtung einer Cell Ranger Multi-Analyse mit Multiplexing

  • Batch-Verarbeitung mehrerer Proben

  • Überwachung und Download von Analyseergebnissen

  • Interpretation von QC-Metriken und Ergebnissen

Beispiel-Prompts und Best Practices für Prompting finden Sie in der 10x Genomics MCP Server-Dokumentation.

Weitere Ressourcen von 10x Genomics

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