L'intégration 10x Genomics transforme l'analyse de cellules uniques et spatiales en un flux de travail simple et conversationnel. Les biologistes peuvent facilement analyser leurs propres données de séquençage, tandis que les laboratoires centraux peuvent rapidement effectuer un traitement par lots. Cet article explique comment configurer et utiliser l'intégration 10x Genomics avec Claude pour améliorer vos flux de travail d'analyse.
L'intégration 10x Genomics est disponible en tant qu'extension de bureau dans l'application Claude Desktop App (télécharger ici), et elle s'appuie sur la capacité de Claude à utiliser des connecteurs locaux via une extension de bureau.
Ce que cette intégration fournit
L'intégration 10x Genomics permet aux chercheurs de créer et de gérer des flux de travail d'analyse de génomique de cellules uniques en conversation avec Claude. Les utilisateurs peuvent télécharger des données, configurer et lancer des pipelines Cell Ranger, surveiller l'état de l'analyse et télécharger les résultats à l'aide d'invites en langage naturel au lieu d'outils en ligne de commande ou d'interfaces web. L'intégration traduit les demandes conversationnelles en actions sur la plateforme 10x Cloud Analysis, rationalisant les flux de travail pour l'expression génique, le multiplexage cellulaire et les analyses de criblage CRISPR.
Qui devrait utiliser l'intégration 10x Genomics
Biologistes informaticiens : Chercheurs qui analysent les données de génomique de cellules uniques et souhaitent rationaliser les flux de travail d'analyse basés sur le cloud
Bioinformaticiens : Scientifiques qui traitent plusieurs échantillons et ont besoin de capacités efficaces de traitement par lots
Chercheurs scientifiques : Chercheurs de laboratoire qui génèrent des données de cellules uniques et souhaitent une interface intuitive pour exécuter des pipelines standard
Responsables des installations centrales : Personnel qui traite les échantillons pour plusieurs groupes de recherche et doit gérer de nombreuses analyses
Qui peut accéder à l'intégration 10x Genomics
Tout utilisateur disposant d'un compte 10x Cloud Analysis (créer un compte gratuit ici)
Plus de détails sur l'accès à l'intégration peuvent être trouvés dans la documentation du serveur MCP 10x Genomics.
Configuration de l'intégration 10x Genomics
L'intégration 10x Genomics est disponible en tant qu'extension de bureau dans l'application Claude Desktop App (télécharger ici). Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise), la configuration de l'intégration implique de rendre l'extension disponible pour votre organisation. Pour les utilisateurs individuels, la configuration de l'intégration implique d'installer l'extension depuis l'application Claude Desktop App.
Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise)
Accédez à Paramètres d'administration > Extensions
Dans le champ de recherche, tapez « 10x Genomics »
Cliquez sur « Activer »
Demandez à votre équipe de télécharger l'application Claude Desktop App pour accéder à l'intégration
Pour les utilisateurs Claude individuels
Téléchargez l'application Claude Desktop App
Accédez à Paramètres > Extensions
Cliquez sur « Parcourir les extensions »
Cliquez sur « 10x Genomics »
Cliquez sur « Installer »
Suivez les instructions pour vous authentifier avec votre compte 10x Cloud Analysis
En savoir plus sur l'installation des extensions de bureau à partir du répertoire.
Les détails techniques de l'intégration 10x Genomics peuvent être trouvés dans la documentation du serveur MCP 10x Genomics.
Pour les utilisateurs de Claude Code
Commande :
/plugin marketplace add anthropics/life-sciencesCommande :
/plugin install 10x-genomics@life-sciencesRedémarrez Claude Code
Commande :
/pluginAccédez à « Gérer et désinstaller les plugins » et configurez le MCP 10x Genomics avec votre jeton d'accès
Redémarrez Claude Code une fois de plus
Vérifiez que le serveur est connecté avec
/mcp
Cas d'usage courants
Configurer une analyse Cell Ranger count
Configurer une analyse Cell Ranger multi avec multiplexage
Traiter par lots plusieurs échantillons
Surveiller et télécharger les résultats de l'analyse
Interpréter les métriques QC et les résultats
Les exemples d'invites et les meilleures pratiques en matière d'invites peuvent être trouvés dans la documentation du serveur MCP 10x Genomics.