Integrasi 10x Genomics mengubah analisis sel tunggal dan spasial menjadi alur kerja yang sederhana dan percakapan. Biolog dapat dengan mudah menganalisis data sekuensing mereka sendiri, sementara lab inti dapat dengan cepat melakukan pemrosesan batch. Artikel ini menjelaskan cara menyiapkan dan menggunakan integrasi 10x Genomics dengan Claude untuk meningkatkan alur kerja analisis Anda.
Integrasi 10x Genomics tersedia sebagai ekstensi desktop di Claude Desktop App (unduh di sini), dan bergantung pada kemampuan Claude untuk menggunakan konektor lokal melalui ekstensi desktop.
Apa yang disediakan integrasi ini
Integrasi 10x Genomics memungkinkan peneliti untuk membuat dan mengelola alur kerja analisis genomik sel tunggal dalam percakapan dengan Claude. Pengguna dapat mengunggah data, mengonfigurasi dan meluncurkan pipeline Cell Ranger, memantau status analisis, dan mengunduh hasil menggunakan prompt bahasa alami alih-alih alat baris perintah atau antarmuka web. Integrasi menerjemahkan permintaan percakapan menjadi tindakan pada platform 10x Cloud Analysis, menyederhanakan alur kerja untuk analisis ekspresi gen, multipleksing sel, dan skrining CRISPR.
Siapa yang harus menggunakan integrasi 10x Genomics
Biolog Komputasi: Peneliti yang menganalisis data genomik sel tunggal dan ingin menyederhanakan alur kerja analisis berbasis cloud
Bioinformatikawan: Ilmuwan yang memproses beberapa sampel dan membutuhkan kemampuan pemrosesan batch yang efisien
Ilmuwan Peneliti: Peneliti lab yang menghasilkan data sel tunggal dan menginginkan antarmuka intuitif untuk menjalankan pipeline standar
Manajer Fasilitas Inti: Staf yang memproses sampel untuk beberapa kelompok penelitian dan perlu mengelola banyak analisis
Siapa yang dapat mengakses integrasi 10x Genomics
Pengguna apa pun dengan akun 10x Cloud Analysis (buat akun gratis di sini)
Detail lebih lanjut tentang mengakses integrasi dapat ditemukan di Dokumentasi 10x Genomics MCP Server.
Menyiapkan integrasi 10x Genomics
Integrasi 10x Genomics tersedia sebagai ekstensi desktop di Claude Desktop App (unduh di sini). Untuk Pemilik Organisasi (Team dan Enterprise), menyiapkan integrasi melibatkan pembuatan ekstensi tersedia untuk organisasi Anda. Untuk pengguna individual, menyiapkan integrasi melibatkan pemasangan ekstensi dari dalam Claude Desktop App.
Untuk Pemilik Organisasi (Team dan Enterprise)
Navigasi ke Admin settings > Extensions
Di bidang pencarian, ketik "10x Genomics"
Klik "Enable"
Instruksikan tim Anda untuk mengunduh Claude Desktop App untuk mengakses integrasi
Untuk Pengguna Claude Individual
Unduh Claude Desktop App
Navigasi ke Settings > Extensions
Klik "Browse extensions"
Klik "10x Genomics"
Klik "Install"
Ikuti instruksi untuk mengautentikasi dengan akun 10x Cloud Analysis Anda
Pelajari tentang memasang ekstensi desktop dari direktori.
Detail teknis integrasi 10x Genomics dapat ditemukan di Dokumentasi 10x Genomics MCP Server.
Untuk Pengguna Claude Code
Perintah:
/plugin marketplace add anthropics/life-sciencesPerintah:
/plugin install 10x-genomics@life-sciencesMulai ulang Claude Code
Perintah:
/pluginNavigasi ke "Manage and uninstall plugins" dan konfigurasikan 10x Genomics MCP dengan token akses Anda
Mulai ulang Claude Code sekali lagi
Verifikasi bahwa server terhubung dengan
/mcp
Kasus penggunaan umum
Siapkan analisis Cell Ranger count
Siapkan analisis Cell Ranger multi dengan multipleksing
Pemrosesan batch beberapa sampel
Pantau dan unduh hasil analisis
Interpretasikan metrik QC dan hasil
Contoh prompt dan praktik terbaik prompting dapat ditemukan di Dokumentasi 10x Genomics MCP Server.