Lewati ke konten utama

Menggunakan Ekstensi 10x Genomics di Claude

Diperbarui minggu ini

Integrasi 10x Genomics mengubah analisis sel tunggal dan spasial menjadi alur kerja percakapan yang sederhana. Ahli biologi dapat dengan mudah menganalisis data sekuensing mereka sendiri, sementara laboratorium inti dapat dengan cepat melakukan pemrosesan batch. Artikel ini menjelaskan cara mengatur dan menggunakan integrasi 10x Genomics dengan Claude untuk memajukan alur kerja analisis Anda.

Integrasi 10x Genomics tersedia sebagai ekstensi desktop di Claude Desktop App (unduh di sini), dan bergantung pada kemampuan Claude untuk menggunakan konektor lokal melalui ekstensi desktop.

Apa yang disediakan integrasi ini

Integrasi 10x Genomics memungkinkan peneliti untuk membuat dan mengelola alur kerja analisis genomik sel tunggal dalam percakapan dengan Claude. Pengguna dapat mengunggah data, mengonfigurasi dan meluncurkan pipeline Cell Ranger, memantau status analisis, dan mengunduh hasil menggunakan perintah bahasa alami alih-alih alat baris perintah atau antarmuka web. Integrasi ini menerjemahkan permintaan percakapan menjadi tindakan pada platform 10x Cloud Analysis, menyederhanakan alur kerja untuk analisis ekspresi gen, multiplexing sel, dan skrining CRISPR.

Siapa yang harus menggunakan integrasi 10x Genomics

  • Ahli Biologi Komputasi: Peneliti yang menganalisis data genomik sel tunggal dan ingin menyederhanakan alur kerja analisis berbasis cloud

  • Ahli Bioinformatika: Ilmuwan yang memproses beberapa sampel dan memerlukan kemampuan pemrosesan batch yang efisien

  • Ilmuwan Peneliti: Peneliti laboratorium yang menghasilkan data sel tunggal dan menginginkan antarmuka intuitif untuk menjalankan pipeline standar

  • Manajer Fasilitas Inti: Staf yang memproses sampel untuk beberapa kelompok penelitian dan perlu mengelola banyak analisis

Siapa yang dapat mengakses integrasi 10x Genomics

Setiap pengguna dengan akun 10x Cloud Analysis (buat akun gratis di sini)

Detail lebih lanjut tentang mengakses integrasi dapat ditemukan di Dokumentasi Server MCP 10x Genomics.

Mengatur integrasi 10x Genomics

Integrasi 10x Genomics tersedia sebagai ekstensi desktop di Claude Desktop App (unduh di sini). Untuk Pemilik Organisasi (Team dan Enterprise), mengatur integrasi melibatkan penyediaan ekstensi untuk organisasi Anda. Untuk pengguna individu, mengatur integrasi melibatkan pemasangan ekstensi dari dalam Claude Desktop App.

Untuk Pemilik Organisasi (Team dan Enterprise)

  1. Navigasi ke pengaturan Admin > Extensions

  2. Di bidang pencarian, ketik "10x Genomics"

  3. Klik "Enable"

  4. Instruksikan tim Anda untuk mengunduh Claude Desktop App untuk mengakses integrasi

Untuk Pengguna Claude Individu

  1. Navigasi ke Settings > Extensions

  2. Klik "Browse extensions"

  3. Klik "10x Genomics"

  4. Klik "Install"

  5. Ikuti instruksi untuk mengautentikasi dengan akun 10x Cloud Analysis Anda

Detail teknis integrasi 10x Genomics dapat ditemukan di Dokumentasi Server MCP 10x Genomics.

Untuk Pengguna Claude Code

  1. Perintah: /plugin marketplace add anthropics/life-sciences

  2. Perintah: /plugin install 10x-genomics@life-sciences

  3. Restart Claude Code

  4. Perintah: /plugin

  5. Navigasi ke "Manage and uninstall plugins" dan konfigurasikan MCP 10x Genomics dengan token akses Anda

  6. Restart Claude Code sekali lagi

  7. Verifikasi bahwa server terhubung dengan /mcp

Kasus penggunaan umum

  • Mengatur analisis Cell Ranger count

  • Mengatur analisis Cell Ranger multi dengan multiplexing

  • Memproses batch beberapa sampel

  • Memantau dan mengunduh hasil analisis

  • Menginterpretasikan metrik QC dan hasil

Contoh perintah dan praktik terbaik prompting dapat ditemukan di Dokumentasi Server MCP 10x Genomics.

Sumber daya lainnya dari 10x Genomics

Apakah pertanyaan Anda terjawab?