Sage Bionetworksによる Synapse.org インテグレーションにより、研究者は Synapse 全体のバイオメディカルデータを発見し、プロジェクトの構造を確認し、認可されたユーザーのデータアセットに関する情報を取得できます。この記事では、Claude で Synapse.org インテグレーションをセットアップして使用し、研究と分析ワークフローを進める方法について説明します。
Synapse.org インテグレーションは、Claude がリモートコネクタを使用する能力に依存しています。
このインテグレーションが提供するもの
サービスには、検索および(メタ)データ取得サービスが含まれます。データアクセスは、各プロジェクトに対して定義されたアクセス制御によって管理されます。一部のデータは公開されていますが、その他のデータは Synapse のガバナンスチームからのアクセス前の承認が必要です。
Synapse.org インテグレーションにアクセスできるユーザー
登録済みの Synapse アカウントを持つ個人(無料で登録)
データアクセスは、貢献者からの使用制限の対象となる場合があります
インテグレーションへのアクセスに関する詳細は、Synapse の MCP サーバードキュメントに記載されています。
Synapse.org インテグレーションのセットアップ
組織オーナー(Team および Enterprise)の場合
Admin settings > Connectors に移動します
「Browse connectors」をクリックします
「Synapse.org」をクリックします
「Add to your team」をクリックします
個別の Claude ユーザーの場合
Settings > Connectors に移動します
「Connect」をクリックします
指示に従って Synapse.org アカウントで認証します
Claude でツールを検索して接続する方法について詳しく学びます。
Claude Code ユーザーの場合
コマンド:
/plugin marketplace add anthropics/life-sciencesコマンド:
/plugin install synapse@life-sciencesClaude Code を再起動します
/mcpでサーバーが接続されていることを確認します
Synapse.org インテグレーションの技術詳細は、Synapse の MCP サーバードキュメントに記載されています。
一般的なユースケース
Synapse.org プラットフォーム全体で再利用可能な科学データを検索します
「Synapse でアルツハイマー病に関連する RNA-seq データセットを検索」
「Synapse でシングルセル転写産物データセットを検索」
「NF Data Portal でプレキシフォーム神経線維腫の全ゲノムシーケンスデータを検索」
認可されたユーザーは、プロジェクト内のフォルダ、ファイル、テーブル、データセットの階層を確認して、データアセットの整理と監視を支援できます
「公開 AACR Project GENIE プロジェクトのファイルとフォルダについて説明」
「SEA-AD チャレンジプロジェクト(syn66496696)のエージェントトラック内のデータアセットの概要を提供」
Synapse のエンティティのカスタムメタデータを取得します
「ファイル syn4553239 のアノテーションとメタデータは何ですか?」
「データセット syn66364675 のカスタムメタデータフィールドを表示」
Synapse のエンティティの由来情報を取得して、過去のデータ処理を理解するのに役立てます
「ファイル syn51543273 の処理履歴は何ですか?」
「データセット syn68719289 のデータ系統と上流の依存関係を表示」
