10x Genomicsインテグレーションは、シングルセルおよび空間解析を簡単な会話型ワークフローに変換します。生物学者は自分のシーケンシングデータを簡単に分析でき、コアラボは迅速にバッチ処理を実行できます。この記事では、Claudeで10x Genomicsインテグレーションをセットアップして使用し、分析ワークフローを向上させる方法について説明します。
10x Genomicsインテグレーションは、Claude Desktop Appのデスクトップ拡張機能として利用可能です(ここからダウンロード)。また、Claudeがデスクトップ拡張機能を通じてローカルコネクタを使用する機能に依存しています。
このインテグレーションが提供するもの
10x Genomicsインテグレーションにより、研究者はClaudeとの会話でシングルセルゲノミクス分析ワークフローを作成・管理できます。ユーザーはデータをアップロードし、Cell Rangerパイプラインを構成・起動し、分析ステータスを監視し、コマンドラインツールやウェブインターフェースの代わりに自然言語プロンプトを使用して結果をダウンロードできます。このインテグレーションは、会話型リクエストを10x Cloud Analysis プラットフォーム上のアクションに変換し、遺伝子発現、セルマルチプレキシング、およびCRISPRスクリーニング分析のワークフローを効率化します。
10x Genomicsインテグレーションを使用すべき人
- 計算生物学者:シングルセルゲノミクスデータを分析し、クラウドベースの分析ワークフローを効率化したい研究者 
- バイオインフォマティシャン:複数のサンプルを処理し、効率的なバッチ処理機能が必要な科学者 
- 研究科学者:シングルセルデータを生成し、標準パイプラインを実行するための直感的なインターフェースが必要なラボ研究者 
- コアファシリティマネージャー:複数の研究グループのサンプルを処理し、多数の分析を管理する必要があるスタッフ 
10x Genomicsインテグレーションにアクセスできる人
10x Cloud Analysisアカウントを持つすべてのユーザー(ここで無料アカウントを作成)
インテグレーションへのアクセスに関する詳細は、10x Genomics MCP Server ドキュメントに記載されています。
10x Genomicsインテグレーションのセットアップ
10x Genomicsインテグレーションは、Claude Desktop Appのデスクトップ拡張機能として利用可能です(ここからダウンロード)。Organization Owner(TeamおよびEnterprise)の場合、インテグレーションのセットアップには、拡張機能を組織で利用可能にすることが含まれます。個別ユーザーの場合、セットアップには Claude Desktop App内から拡張機能をインストールすることが含まれます。
Organization Owner(TeamおよびEnterprise)の場合
- Admin settings > Extensionsに移動 
- 検索フィールドに「10x Genomics」と入力 
- 「Enable」をクリック 
- チームにClaude Desktop Appをダウンロードしてインテグレーションにアクセスするよう指示 
個別Claudeユーザーの場合
- Claude Desktop Appをダウンロード 
- Settings > Extensionsに移動 
- 「Browse extensions」をクリック 
- 「10x Genomics」をクリック 
- 「Install」をクリック 
- 指示に従って、10x Cloud Analysisアカウントで認証 
ディレクトリからデスクトップ拡張機能をインストールする方法について詳しく学びます。
10x Genomicsインテグレーションの技術詳細は、10x Genomics MCP Server ドキュメントに記載されています。
Claude Codeユーザーの場合
- コマンド: - /plugin marketplace add anthropics/life-sciences
- コマンド: - /plugin install 10x-genomics@life-sciences
- Claude Codeを再起動 
- コマンド: - /plugin
- 「Manage and uninstall plugins」に移動し、アクセストークンで10x Genomics MCPを構成 
- Claude Codeをもう一度再起動 
- /mcpでサーバーが接続されていることを確認
一般的なユースケース
- Cell Ranger count分析をセットアップ 
- マルチプレキシングを使用したCell Ranger multi分析をセットアップ 
- 複数のサンプルをバッチ処理 
- 分析結果を監視してダウンロード 
- QCメトリクスと結果を解釈 
サンプルプロンプトとプロンプティングのベストプラクティスは、
