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在 Claude 中使用 10x Genomics 扩展

更新于今天

10x Genomics 集成将单细胞和空间分析转变为简单的对话式工作流程。生物学家可以轻松分析自己的测序数据,而核心实验室可以快速执行批量处理。本文介绍如何设置和使用 10x Genomics 集成与 Claude 来推进您的分析工作流程。

10x Genomics 集成可作为 Claude Desktop App 中的桌面扩展程序提供(在此下载),它依赖于 Claude 通过桌面扩展程序使用本地连接器的能力。

该集成提供的功能

10x Genomics 集成使研究人员能够通过与 Claude 的对话来创建和管理单细胞基因组学分析工作流程。用户可以上传数据、配置和启动 Cell Ranger 管道、监控分析状态,以及使用自然语言提示而不是命令行工具或网络界面来下载结果。该集成将对话请求转换为 10x Cloud Analysis 平台上的操作,简化了基因表达、细胞多重化和 CRISPR 筛选分析的工作流程。

谁应该使用 10x Genomics 集成

  • 计算生物学家:分析单细胞基因组学数据并希望简化基于云的分析工作流程的研究人员

  • 生物信息学家:处理多个样本并需要高效批量处理能力的科学家

  • 研究科学家:生成单细胞数据并希望获得直观界面来运行标准管道的实验室研究人员

  • 核心设施管理员:为多个研究小组处理样本并需要管理众多分析的工作人员

谁可以访问 10x Genomics 集成

任何拥有 10x Cloud Analysis 账户的用户(在此创建免费账户

有关访问该集成的更多详情,请参阅 10x Genomics MCP Server 文档

设置 10x Genomics 集成

10x Genomics 集成可作为 Claude Desktop App 中的桌面扩展程序提供(在此下载)。对于组织所有者(Team 和 Enterprise),设置集成涉及向您的组织提供该扩展程序。对于个人用户,设置集成涉及从 Claude Desktop App 内部安装扩展程序。

对于组织所有者(Team 和 Enterprise)

  1. 导航到管理设置 > 扩展程序

  2. 在搜索字段中,输入"10x Genomics"

  3. 点击"启用"

  4. 指示您的团队下载 Claude Desktop App 以访问该集成

对于个人 Claude 用户

  1. 导航到设置 > 扩展程序

  2. 点击"浏览扩展程序"

  3. 点击"10x Genomics"

  4. 点击"安装"

  5. 按照说明使用您的 10x Cloud Analysis 账户进行身份验证

了解有关从目录安装桌面扩展程序的信息。

10x Genomics 集成的技术详情可在 10x Genomics MCP Server 文档中找到。

对于 Claude Code 用户

  1. 命令:/plugin marketplace add anthropics/life-sciences

  2. 命令:/plugin install 10x-genomics@life-sciences

  3. 重启 Claude Code

  4. 命令:/plugin

  5. 导航到"管理和卸载插件"并使用您的访问令牌配置 10x Genomics MCP

  6. 再次重启 Claude Code

  7. 使用 /mcp 验证服务器已连接

常见用例

  • 设置 Cell Ranger 计数分析

  • 设置具有多重化功能的 Cell Ranger 多分析

  • 批量处理多个样本

  • 监控和下载分析结果

  • 解释 QC 指标和结果

示例提示和提示最佳实践可在 10x Genomics MCP Server 文档中找到。

来自 10x Genomics 的更多资源

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